Une nouvelle étude publiée dans Plant Pathology identifie pour la première fois les génotypes de P. infestans, à l'origine du mildiou dans les principales régions productrices de pommes de terre de Java, en Indonésie.
La maladie du mildiou de la pomme de terre est considérée comme la cause de la grande famine irlandaise de la pomme de terre en 1845. Elle a été qualifiée de pire de toutes les maladies connues de la pomme de terre. Les agriculteurs espèrent des solutions efficaces et durables contre le mildiou alors que les chercheurs continuent d'étudier et de comprendre Phytophthora infestans, le micro-organisme de type champignon qui cause la maladie.
Une nouvelle étude, Caractérisation génotypique et phénotypique de Phytophthora infestans populations de Java, Indonésie, publié dans Plant Pathology identifie pour la première fois les génotypes, ou souches de P. infestans, causant le mildiou dans les principales régions productrices de pommes de terre de l'île de Java en Indonésie et, deuxièmement, examine la diversité de la constitution génétique dans le P. infestans populations de ces régions.
«Les chercheurs utilisent des technologies de sélection pour développer des solutions qui offrent une résistance à P. infestans. Ainsi, comprendre les génotypes et la diversité génotypique du pathogène et leur évolution est essentiel pour obtenir une résistance durable et durable à la maladie », note le Dr Phillip Wharton, professeur agrégé au College of Agriculture and Life Sciences de l'Université de l'Idaho auteur principal de la publication.
Des chercheurs américains de l'Université de l'Idaho, de l'Université du Minnesota et de la Michigan State University ont collaboré avec des collègues du Centre indonésien de recherche et de développement des biotechnologies agricoles et des ressources génétiques (ICABIOGRAD) pour collecter et étudier P. infestans échantillons sur une période de quatre ans (2016-19) provenant de 15 sites dans neuf régences à Java, en Indonésie. L'analyse des microsatellites a révélé que les épidémies de mildiou dans ces régences étaient causées par EU_2_A1, un génotype européen, et d'autres génotypes étroitement liés à EU_2_A1 mais propres à l'Indonésie.
Ces résultats suggèrent que le génotype original introduit en Indonésie était probablement EU_2_A1 et qu'il y a une évolution en cours dans ces populations en raison d'un taux de mutation élevé et de l'absence de pression de sélection des hôtes de pomme de terre sensibles qui sont actuellement cultivés en Indonésie.
L'équipe de recherche fait partie du Partenariat pour la pomme de terre Feed the Future Biotechnology (BPP). Dirigé par l'Université de l'État du Michigan, le projet vise à offrir des pommes de terre génétiquement modifiées résistantes au mildiou aux petits agriculteurs du Bangladesh et d'Indonésie.
Le développement de pommes de terre génétiquement modifiées est un processus en plusieurs étapes dans lequel des gènes spécifiques sont insérés dans le génome de la variété de pomme de terre souhaitée. L'expression protéique du ou des gènes dans la plante peut entraîner des changements dans la manière dont la plante réagit aux facteurs de stress tels que l'infection par un agent pathogène. Dans ce projet, trois gènes d'espèces de pommes de terre sauvages qui sont connues pour fournir une résistance naturelle à la maladie du mildiou sont insérés dans les variétés préférées des agriculteurs et des consommateurs. Le résultat est une variété de pomme de terre préférée qui offre une protection durable contre les maladies.
Les avantages de la pomme de terre résistante au mildiou comprennent la réduction de l'exposition aux fongicides chimiques. Wharton estime que les pulvérisations de fongicides chimiques actuellement utilisées pour lutter contre le mildiou pourraient être réduites jusqu'à 90%. «Cela réduit considérablement le contact direct des agriculteurs et de leurs familles avec des produits chimiques synthétiques qui sont souvent appliqués chaque semaine pendant toute la saison de croissance et souvent sans équipement de protection individuelle laissant des résidus sur eux-mêmes, dans le sol et sur les pommes de terre», explique Wharton. «Moins d'application de fongicide équivaut à moins d'exposition aux produits chimiques synthétiques pour les producteurs, les consommateurs et l'environnement.»
La résolution du problème du mildiou peut également entraîner une diminution des pertes après récolte et une augmentation du rendement. Les premiers résultats d'essais en champ confiné avec trois gènes de pommes de terre résistantes au mildiou en Indonésie semblent montrer qu'il existe une corrélation entre l'absence de la maladie et des rendements plus élevés.
«Bien qu'il reste encore beaucoup à faire dans la recherche, les premiers signes indiquent qu'une pomme de terre résistante au mildiou pourrait également profiter à une population croissante avec une production plus élevée», dit Wharton. Avec une population mondiale qui devrait dépasser les neuf milliards d'ici 2050 et beaucoup plus de bouches à nourrir, c'est une nouvelle positive.
Wharton et l'équipe du Biotechnology Potato Partnership, qu'il a surnommée les chasseurs de mildiou, ont conduit des P. infestans enquêtes dans tout le Bangladesh, autre axe géographique du projet. Les résultats de ces enquêtes devraient être publiés prochainement.
